Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc166S4R181 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms