Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms