Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Knop1Q9Z2Q2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms