Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps6ka4Q9Z2B9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms