Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccl27Q9Z1X0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ccl27Q9Z1X0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccl27Q9Z1X0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccl27Q9Z1X0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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