Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dctn3Q9Z0Y1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms