Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cib1Q9Z0F4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cib1Q9Z0F4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms