Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pacsin2Q9WVE8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms