Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slit3Q9WVB4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slit3Q9WVB4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms