Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nme3Q9WV85 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme3Q9WV85 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms