Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms