Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms