Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn5Q9WU28 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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