Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skp1Q9WTX5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms