Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema6cQ9WTM3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema6cQ9WTM3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms