Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Spo11Q9WTK8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spo11Q9WTK8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms