Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PplQ9R269 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PplQ9R269 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms