Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn7Q9R1S8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms