Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp2b2Q9R0K7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp2b2Q9R0K7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms