Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Plod1Q9R0E2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Plod1Q9R0E2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms