Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Plod2Q9R0B9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms