Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nubp2Q9R061 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nubp2Q9R061 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Nubp2Q9R061 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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