Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmfrQ9R049 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmfrQ9R049 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms