Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gpc1Q9QZF2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc1Q9QZF2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc1Q9QZF2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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