Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf11Q9QYK7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms