Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh11Q9QYF1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh11Q9QYF1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms