Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg2Q9QXK3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Copg2Q9QXK3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms