Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cyth1Q9QX11 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms