Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Homer2Q9QWW1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Homer2Q9QWW1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms