Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkl2Q9QUK0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms