Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rabgef1Q9JM13 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rabgef1Q9JM13 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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