Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Tmod4Q9JLH8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Tmod4Q9JLH8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmod4Q9JLH8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Tmod4Q9JLH8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Tmod4Q9JLH8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Tmod4Q9JLH8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Tmod4Q9JLH8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmod4Q9JLH8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms