Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrac1Q9JKP8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms