Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms