Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Stx6Q9JKK1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Stx6Q9JKK1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms