Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ybx3Q9JKB3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms