Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3glb1Q9JK48 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3glb1Q9JK48 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms