Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnga3Q9JJZ8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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