Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Zfhx4Q9JJN2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zfhx4Q9JJN2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms