Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smad9Q9JIW5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms