Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmbr1Q9JIT0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmbr1Q9JIT0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms