Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cacna1fQ9JIS7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacna1fQ9JIS7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms