Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tssc4Q9JHE7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tssc4Q9JHE7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms