Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trim39Q9ESN2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim39Q9ESN2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trim39Q9ESN2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim39Q9ESN2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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