Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Usp29Q9ES63 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp29Q9ES63 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp29Q9ES63 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp29Q9ES63 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp29Q9ES63 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp29Q9ES63 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp29Q9ES63 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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