Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a44Q9EQW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp3a44Q9EQW4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms