Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox9Q9EQM5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhox9Q9EQM5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms