Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SgshQ9EQ08 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms