Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vmn1r56Q9EPS9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r56Q9EPS9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r56Q9EPS9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r56Q9EPS9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r56Q9EPS9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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