Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms